Ako som spomenula v predchádzajúcom článku, dva roky po smrti Františka z Assisi bol nad jeho hrobom založený kostol, resp. gotická Bazilika svätého Františka z Assisi, ktorá je kľúčovou sakrálnou stavbou v meste Assis. Rovnako predstavuje jedno z najvýznamnejších pútnických miest katolíckej cirkvi. Bazilika sv. Františka patrí k najstarším gotickým pamiatkam v Taliansku. Jej výstavba začala v roku 1228 a bola dokončená až o 25 rokov neskôr. Bazilika je postavená na úbočí kopca a pozostáva z dvoch kostolov, resp. z Horného a Dolného a kláštora Sacro Convento. Súčasťou sú samozrejme aj krypty, v ktorých sú uložené pozostatky svätého Františka z Assisi.
Horná časť je postavená v gotickom slohu a je známa svojimi freskami, ktoré vyobrazujú život svätého Františka. Tieto fresky boli namaľované niekoľkými významnými umelcami, vrátane Cimabue a Giotta.
Bazilika bola postavená na začiatku 13. storočia a je príkladom vznešenej gotickej architektúry. Druhou časťou je tzv. Dolná bazilika bola vystavaná pod hornou a je známa freskami vyobrazujúcimi rôzne scény z Biblie a taktiež života sv. Františka. 
Tieto fresky sú taktiež dielom významných umelcov. Časť tejto baziliky obsahuje taktiež gotické prvky, no zároveň si zachováva vplyvy románskej architektúry. Kvalita Baziliky svätého Františka ako umeleckého diela umocňuje jej jedinečnosť pri demonštrácii kvalitatívneho rozvoja talianskeho umenia tohto obdobia.
Bazilika bola vybudovaná na počesť miestneho svätca Františka s Assisi, hneď po jeho kanonizácii, resp. po vyhlásení za svätého. Simone di Pucciarello daroval pozemok, na ktorom mal byť vystavaný kostol.
Išlo o miesto na západnej strane Assisi nazývané ako Colle d’inferno, resp. Pekelný vrch, na ktorom sa pôvodne zabíjali zločinci. Postupom času až do súčasnosti za jeho prestavbou jeho názvov premenoval na Collina del Paradiso, resp. Rajský vrch. 
V roku 1997 Baziliku sv. Františka zasiahlo zemetrasenie, ktoré do veľkej miery poškodilo budovu. Interiér je zdobený 27 freskami zo života svätca, ktoré vytvoril maliar a architekt Giotto di Bondone. Bazilika je od roku 2000 súčasťou svetového kultúrneho dedičstva UNESCO.
